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托克逊县是历史上著名的“丝绸之路”上的重镇之一，位于天山中部、吐鲁番盆地西缘，属南疆、北疆、东疆三疆的交汇之地。县城海拔0米，是全国唯一的零点城。G30线、G3012线、兰新铁路、南疆铁路穿境而过，有2个货运火车站。县城北距乌鲁木齐市160公里，南距库尔勒市300公里，东距吐鲁番市50公里，西与和硕、和静县毗邻，曾是古丝绸之路上的著名驿站。县境内除西部、南部及北部边缘为山地外，大部分地区为砾石戈壁带，绿洲位于白杨河、阿拉沟水系下游，沿河岸地带西北部山间有草滩牧场。

托克逊县成立于1935年6月，总面积1.66万平方公里，辖一乡七镇、44个行政村、19个社区。

托克逊县现有耕地17.11千公顷，建有标准日光温室大棚6027座，有天然草场476.7万亩、森林面积129923公顷，森林覆盖率达3.40%。盛产红枣、哈密瓜、蔬菜、白高粱、孜然、花生等农副产品。畜牧养殖主要有黑羊、西门塔牛、荷斯坦牛等，其中“托克逊黑羊”2009年被列为《国家优良品种遗传资源保护目录》，2011年注册了“托克逊黑羊”原产地证明商标，通过国家有机食品认证，并建立了“托克逊黑羊”保种基地。

托克逊县属典型大陆性暖温带荒漠气候，光照充足、热量丰富，年均气温15.1℃，全年平均时数3134.9小时，降水量5.7毫米，蒸发量3171.4毫米，无霜期可达219天。托克逊素有“风库”之称，全年主导风向为西风，年均风速8m/s，且风速较为平稳。

托克逊县水源为北部和西部高山冰川融水，主要有白杨河、阿拉沟、鱼尔沟、乌斯通沟等六大水系，水资源总量5.96亿立方米（地表水资源4.13亿立方米，地下水资源1.83亿立方米），现有库容5350万立方米的红山水库，库容4450万立方米的阿拉沟水库，库容1440万立方米的乌斯通沟水库正在建设中。

托克逊县矿产资源十分富集，现已发现矿产41种，开发利用24种。其中：煤炭探明储量超过100亿吨，主要分布在克布尔碱矿区、乌尊布拉克矿区、黑山矿区、县城南部矿区，多为特低硫、特低磷、高热量、高油、高碳质动力煤；石灰岩储量达100亿吨；盐矿储量1亿吨；钨储量3万余吨，属国家第二大矿；膨润土储量1.2亿吨，目前国内第二大矿；蒙皂石矿国内首次发现，探明储量156万吨，属世界稀有非金属矿种。

托克逊县境内有雅丹地貌、红山水库、洄流、盘吉尔怪石林、巴依托海草场等自然景观，有以保存完好的唐代烽火台为代表的古迹遗址40处，属自治区级文物保护单位5处、县级文物保护单位26处，其中克尔碱岩画石刻水系图为世界首次发现，具有较高的研究价值。